Destacat »

14 juny 2017 – 12:00

El COEINF, en col·laboració amb l’Associació Bioinformàtics Barcelona (BIB), vol facilitar l’entrada dels enginyers a la Bioinformàtica, oferint formació i creant una comissió o taula tècnica amb col·legis i associacions de professionals de l’enginyeria per …

Read the full story »
Col·legi

el Col·legi, informació rellevant sobre el COEINF, activitats, relacions i varis

Formació

formació continuada i orientació professional, convenis de formació amb altres entitats

Esdeveniments

tots els esdeveniments rellevants del sector TIC

Informes

informes, estudis, enquestes, … relacionats amb les tecnologies de la informació

Professió

món laboral, emprenedors, enginyers en informàtica, entrevistes, certificacions, deontologia, carreres professionals, …

Home » Notícies

L’IRB Barcelona crea la primera plataforma de simulacions d’ADN

Submitted by on 24 novembre 2015 – 17:00No Comment
Share Button

L’IRB Barcelona ha desenvolupat un sistema avançat de simulacions d’ADN, així com la primera plataforma per fer-ho.

Veure per simulació que no és possible observar directament per mitjans experimentals. La dinàmica molecular és una tècnica que permet simular el moviment de l’ADN, el seu plegament en doble, triple o quàdruple bri, o fins i tot la seva interacció amb proteïnes i fàrmacs. S’intenta amb ella estudiar processos que ocorren en escales de temps que van dels picosegons als minuts, i que s’apliquen a sistemes moleculars de grandàries diverses, des d’uns pocs nanòmetres al metre.

adn

Metodologia teòrica
El Laboratori de Modelització Molecular i Bioinformàtica de l’Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona), liderat per Modesto Orozco desenvolupa metodologia teòrica per entendre millor el comportament de les biomacromolècules i, en particular, dels àcids nucleics, en una àmplia escala espaitemporal, amb èmfasi en aplicacions biomèdiques i bionanotecnològiques.

El grup publica a Nature Methods un nou model desenvolupat en col·laboració amb el Barcelona Supercomputing Center (BSC) i laboratoris d’Anglaterra i Estats Units, que permet simular la dinàmica de l’ADN a nivell atòmic «amb una exactitud excepcional», celebren els investigadors, després de cinc anys de treball i havent-testat en més de 100 sistemes d’ADN.

Moviment dels àtoms de l’ADN
Els científics han desenvolupat el que s’anomena un camp de força, un conjunt de funcions matemàtiques que descriuen el moviment dels àtoms que integren la molècula d’ADN. «Mai abans un camp de força permetre l’estudi d’estructures tan diverses, en temps rellevants per entendre fenòmens biològics», assegura Pablo Dans Puiggròs, investigador de l’IRB Barcelona i primer signant de l’article al costat d’Ivan Ivani, estudiant de doctorat en el mateix laboratori .

Al seu torn, els autors presenten la primera plataforma dedicada a simulacions d’àcids nucleics, de la qual emfatitzen que «permet predir propietats de l’ADN que poden ser després contrastades directament amb experiments». «Esperem que la plataforma desenvolupada permeti obrir el nostre treball i metodologia a una àmplia comunitat d’usuaris», afirma Modesto Orozco, director del projecte.

Ús del mètode
Les possibles aplicacions abasten la biomedicina i les nanotecnologies, proporcionant informació sobre els mecanismes íntims de regulació de l’ADN i contribuint a millorar fàrmacs que directament o indirectament tenen l’ADN com a diana. «Fem un salt quantitatiu en la qualitat de les simulacions atomístiques de l’ADN», afirma Pablo Dans Puiggròs.

«Els avenços en simulació ens estan acostant a definir un model teòric que permeti simular els aspectes claus de la vida cel·lular i, per tant, ens aproximen al somni de descriure el comportament dels éssers vius a partir de les regles bàsiques de la física i la química », destaca Modesto Orozco, també catedràtic de la Universitat de Barcelona i director del departament de Ciències de la Vida del BSC.

Font: 100tek (Ciència i Tecnologia)

Etiquetes:

Aquesta web utilitza 'cookies' pròpies i de tercers per oferir-te una millor experiència i servei. Al navegar o utilitzar els nostres serveis, acceptes l'ús que fem de les 'cookies'. De tota manera, pots canviar la configuració de 'cookies' en qualsevol moment ACEPTAR
Aviso de cookies
Check Our FeedVisit Us On LinkedinVisit Us On TwitterVisit Us On Facebook